1999 жыл
Республикалық астық инспекциясы «Республикалық астық сараптамасы» кәсіпорны болып қайта құрылды. Республикалық мемлекеттік тұқым инспекциясы «Қазтұқымсараптама» кәсіпорны болып өзгертілді.
2000 жыл
«Қазтұқымсараптама» және «Республикалық астық сараптамасы» кәсіпорындары «Қазагрэкс» болып біріктірілді.
2002 жыл
«Қазагрэкс» мемлекеттік кәсіпорнын мемлекеттің 100% қатысуымен жабық акционерлік қоғамға айналдыру басталды.
Қазіргі кезең
Кейін ұйым Қазақстан Республикасының заңнамасына сәйкес «ҚазАгрЭкс» акционерлік қоғамы болып қайта құрылды.